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饲养环境多尘、潮湿，或接触发霉变质的饮料、巢料、巢材，常会引起鸟的曲霉菌病。长时间的抗生素治疗、维生素A缺乏、误食腐败食物是鸟的念珠菌病的诱因。常用于治疗鸟的真菌性疾病的芗有：两性霉素B、5-氟胞嘧啶、酮康唑、制霉菌素等。给药方法可用混饲、饮水、喷雾、注射等。
给药方式
从避免应激的角度来看，通过混饲或饮水的途径给药，是理想的给药方式。可将谷物饲料在药液中浸泡后喂鸟，或将药粉与粉状料充分混和后喂鸟。水中投药法可能因剂量难以控制或药物的稳定性等因素面受到限制，只适应于某些特殊民政部下动用。上述给药方法只有在药物被鸟吃入的民政部下才能起到作用，所以投药后要加强观察。为了保证鸟能吃进足够量的药物，可以先用少量饲料将药物拌入后喂鸟，待鸟把混有药物的饲料吃完后，再补足正常量的饲料。
注射疗法的优点是给药量便于准确控制，药物被吸收快，显效也快。肌肉注射的部位在胸肌。用酒精擦拭后用锐利的针头插入，抽出时要按压止血。配27号针头的胰岛素注射器很适合小鸟的肌肉注射。静脉输液在观赏笼鸟的治疗中也很普遍。静脉输液的部位可选择右侧颈静脉、尺骨正中静脉、翼静脉、跗内侧静脉等。静脉输液量（基础量）：雀科鸣鸟为0.5毫升；虎皮鹦鹉为1.0毫升；金刚鹦鹉为12毫升。在鸟的尺骨远端外侧面内置导管（带管心针的20号针头）也越来越常用，注入骨内的液体会很快被吸收，而且显效快。 嗉囊内插管或插胃管给药方法也可采用。小型鸟只可用球头金属嗉囊针头，应轻轻地将其放进嗉囊中，或使用一个非常小的盲端胃管。拉长鸟的膀子是快速插入胃管的关键，对大型鸟尤其如此。嗉囊插管时，可用小手电筒通过张开的鸟嘴观察插管的位置。
在诊断和治疗过程中，有时需对鸟进行镇静。氯胺酮肌肉注射（30毫克千克体重）对于即使病重的鸟通常也是安全的，缺点是复苏时间较长；异氟烷麻醉对受到刺激的鸟或衰弱的鸟可安全地进行镇静，而且苏醒也快。
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